甲醇被大眾所熟知，具有毒性。工業酒精中大約含有4%的甲醇，若被不法分子當作食用酒精制作假酒，飲用后，會產生甲醇中毒。甲醇的致命劑量大約是70毫升。

　　甲醇的毒性對人體的神經系統和血液系統影響最大，它經消化道、化工原料呼吸道或皮膚攝入都會產生毒性反應，甲醇蒸氣能損害人的呼吸道粘膜和視力。在甲醇生產工廠，中國有關部門規定，空氣甲醇的濃度限制為PC-stel=50mg/m3，PC-TWA=25mg/m3，在有甲醇氣的現場工作須戴防毒面具、工廠廢水要處理后才能排放，允許含量小于200mg/L的甲醇。

　　甲醇的中毒機理是，甲醇經人體代謝產生甲醛和甲酸（俗稱蟻酸），然后對人體產生傷害。常見的癥狀是，先是產生喝醉的感覺，數小時后頭痛，惡心，嘔吐，以及視線模糊。嚴重者會失明，乃至喪命。失明的原因：甲醇的代謝產物甲酸累積在眼睛部位，破壞視覺神經細胞。腦神經也會受到破壞，而產生永久性損害。甲酸進入血液后，會使組織酸性越來越強，損害腎臟導致腎衰竭。

　　毒性：屬低毒毒性。

　　急性毒性：LD50：5628mg/kg（大鼠經口），15800mg/kg（兔經皮）；LC50：82776mg/kg，4小時（大鼠吸入）；人經口5～10ml，潛伏期8～36小時，致昏迷；人經口15ml，48小時內產生視網膜炎，失明；人經口30～100ml中樞神經系統嚴重損害，呼吸衰弱，死亡。

　　亞急性和慢性毒性：大鼠吸入50mg/m3，12小時/天，3個月，化工原料甲醇在8～10周內可見到氣管、支氣管粘膜損害，大腦皮質細胞營養障礙等。